المتحف القبطي هو مؤسسة غير هادفة للربح مخصصة لتاريخ الفن والحضارة القبطية والتطور لهذا الجزء الحيوي من الثقافة والمجتمع المصري الذي شهدته هذه الفترة المهمة من تاريخ وحضارة مصر.
الحفاظ على الفن القبطي باعتباره فناُ شعبياُ عمِل كحلقة وصل بين الحضارة المصرية القديمة واليونانية والرومانية حتى الحضارة الإسلامية، وكذلك تبادل المعرفة حول الفن القبطي والذي يساهم في رفع مستوى الوعي.
يعتبر المتحف مركز المعرفة والحوار والإلهام الذي ينير الفن والحضارة القبطية.
