يقع المتحف القبطي داخل حدود حصن بابليون الروماني بمنطقة مجمع الأديان بحي مصر القديمة. يضم المتحف القبطي أكبر مجموعة من الآثار القبطية في العالم، يتكون المتحف من جناحين يربط بينهما ممر؛ الجناح القديم افتتح في 14 مارس 1910م، والجناح الجديد تم افتتاحه في 20 فبراير 1947م. في 20 ديسمبر 2021م، قرر مجلس إدارة المجلس الأعلى للآثار تسجيل مبني المتحف القبطي ضمن الآثار الإسلامية والقبطية واليهودية.